上都军与大都军在居庸关、古北口一带展开激战。上都军虽然在大都城下屡次受挫，仍声势浩大。正当上都军全力南进时，在东北的东路蒙古元帅不花帖木儿(燕帖木儿之叔)与搠只哈撒儿后王齐王月鲁不花，在十月十三日乘虚进围上都，留守倒剌沙等出降。阿剌吉八被俘。上都的支持者失去首领，相继溃散瓦解。梁王王禅及倒剌沙、纽泽等均被处死。 　　

　　两都之战刚结束，明宗、文宗兄弟间的争权斗争又起。天历二年(1329)正月，和世束在和林之北，即皇帝位，是为明宗，蒙古号忽都笃汗，立图帖睦尔为皇太子。五月，图帖睦尔自大都出发北上，迎明宗，镇南王帖木儿不花等随行。明宗南下，八月初，至上都附近的旺兀察都之地，图帖睦尔来见。几日后，明宗暴死。图帖睦尔在上都以皇太子复即皇帝位，是为文宗，蒙古号札牙笃汗。 　　

　　文宗即位后，调动数省兵力，才平息了四川、云南等地的蒙古诸王叛乱。
在文宗统治时期，汉文化得到多方面的提倡。天历二年(1329)二月，文宗在大都建立奎章阁学士院，聚集人才，汉族的儒学在蒙古、色目人中进一步发扬。同年九月，又命翰林国史院与奎章阁学士院编纂《经世大典》。《经世大典》不仅保存了大量的元代典制纪录，成为明初纂修《元史》的依据，而且是文宗行"汉法"崇文治的一个标志。文宗在信用文臣的同时，又极力表示尊孔崇儒，以争取汉人文士的拥戴。 　　

　　文宗初即位，以燕铁木儿为中书右丞相，封太平王。文宗复位，又因燕铁木儿"大有勋劳于王室"，加封太师，追封三代，把持朝政。他的儿子唐其势扬言"天下本我家天下"。文宗受制于权相燕铁木儿，元朝国势日渐衰落。 　　

　　1332年(至顺三年)八月，文宗在上都病死。九月，卜答失里后奉遗诏，立明宗次子，八不沙后所生的懿必质班作皇帝(宁宗)。宁宗年仅七岁，即位不满两月病死。
宁宗死后，燕铁木儿请立文宗幼子燕帖古思。卜答失里后不允，遣使自广西迎回妥欢贴睦尔。燕铁木儿仍持异议，迁延数月不决。不久，燕铁木儿病死。1333年(至顺四年)六月，卜答失里后立妥欢贴睦尔为帝，是为惠宗，即顺帝，蒙古号兀哈笃汗。 　　

　　元朝的灭亡 　　

　　元朝末年，吏治腐败，财政破产，军备废弛。蒙古贵族伯颜独秉国政，任中书右丞相，被封为秦王，总领蒙古、钦察、斡罗思诸卫军都指挥使。任命的官员多向伯颜行贿，台宪官也都议价得官。伯颜一次所受赐田多达五千顷。大批蒙古贵族、官僚通过受赐、占夺等方式转化为大土地所有者。汉族地主也大肆兼并土地，广大农民破产流亡。　　

　　在元朝历代宰相中，伯颜权势之显赫，是少有的。他排斥蒙古诸王，仇视汉人，扬言要杀张、王、刘、李、赵五姓汉人。他还下令废止科举，禁止汉人、南人学蒙古、色目文字。 　　

　　1340年(后至元六年)二月，伯颜侄脱脱得到惠宗支持，乘伯颜出外行猎，将他贬黜。惠宗起用脱脱当政。次年，改元至正，宣布"更化"，恢复科举取士，开马禁，减盐额，修辽、金、宋三史，政治一度较为稳定。到脱脱第二次出任中书右丞相时，国库空虚，灾荒频仍。为解救危机，他变更钞法，拯救河患，但这些都未能缓和已全面激化的社会矛盾。元末阶级矛盾和民族矛盾的极端尖锐化，终于导致了元末农民起义。这次起义规模大，时间久，以红巾军为主力的农民起义军沉重打击了元朝在全国各地的统治，终于在1368年(至正二十八年)推翻了元王朝。