公元13-14世纪。公元1271年，北方蒙古族政权入中原，建立了元朝。13世纪初，成吉思汗由中亚细亚回师，亲率大军经临洮进占西宁州，并在河州（今临夏县）设置"吐蕃宣慰司都元帅府"，管理甘肃、川北、青海一带吐蕃等族广大牧区，湟水流域各县，均受制于西宁州。当时牧区推行土司制度，并封吐蕃部落的上层分子为土司、千百户等职，以统治所辖地区。在这一时期，青海的游牧部落获得了安定生息。这时，在成吉思汗的支持下，藏传佛教在青海逐渐盛行起来，并建立了许多寺院。

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