沈有容受命之后，在整备军旅的同时，下令禁止沿海商人与荷兰人私自贸易，在一切准备妥当后，沈有容率领一支舰队驶抵澎湖。舰队在港内抛锚后，他就带着从狱中放出的翻译林玉同坐一只小艇去会见韦麻郎。

　　沈有容对韦麻郎说：“我国朝廷规定，凡不是朝贡的国家，一律不准通商。你们在这里不能通商获利，就应早日撤离澎湖。”

　　谁知沈有容的话音刚落，一帮荷兰殖民者刷地抽出战刀，逼向沈有容。他们以为人多势众，又有兵器在手，一定能把沈有容吓倒。哪知道沈有容毫无惧色，反而厉声责问：“中国惯于杀贼，你们自称是商人，所以从宽处理，责令离境。他们怎么又要打仗呢？你们本来就不怀好意！”

　　话虽这么说，可是韦麻郎一伙是硬赖着不走。沈有容在船上等了１个月，还不见韦麻郎撤离，就召集部将们商量，决定一面向巡抚报告情况；一面命令舰队挂帆起锚，让荷兰人知道他们要回福建去。韦麻郎接到报告，急忙坐小艇来会见沈有容，慌忙问道：“沈将军，要到哪里去啊？”

　　沈有容严肃地说：“当初，任巡抚调集大军，准备前来讨伐，只因我说你们是来要求通商的，经过交涉，你们就会撤离，所以才按兵未动。哪知道你们不听我的劝告，还在这里徘徊不走，一定有什么不可告人的阴谋吗！我只好回去复命，待巡抚发兵征讨，你们就后悔莫及了。”

　　　　韦麻郎本想仗着铁甲舰和先进的大炮打开中国大门，但是他看到沈有容一身正气，要侵占澎湖并不是一件容易的事，再加上他们兵力太少，又远离荷兰本土，即使侥幸获胜，也难以坚持。最后，他们便灰溜溜地于１６０４年１２月２５日撤离了澎湖。